Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM193AP78312 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM193AP78312 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms