Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM4P67936 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM4P67936 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM4P67936 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM4P67936 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms