Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms