Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS25P62851 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS25P62851 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS25P62851 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS25P62851 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPS25P62851 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms