Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCS1P62166 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCS1P62166 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCS1P62166 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NCS1P62166 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCS1P62166 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCS1P62166 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NCS1P62166 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NCS1P62166 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCS1P62166 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCS1P62166 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms