Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO4P61968 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO4P61968 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms