Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ROMO1P60602 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms