Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP4BP1P59074 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms