Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL3P58872 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL3P58872 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms