Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA9P57773 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA9P57773 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA9P57773 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA9P57773 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms