Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL23P55773 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL23P55773 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL23P55773 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms