Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFDNP55196 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFDNP55196 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFDNP55196 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFDNP55196 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFDNP55196 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AFDNP55196 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AFDNP55196 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AFDNP55196 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFDNP55196 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFDNP55196 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFDNP55196 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFDNP55196 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFDNP55196 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms