Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms