Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP1P54849 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMP1P54849 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP1P54849 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms