Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSBP53539 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSBP53539 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSBP53539 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSBP53539 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSBP53539 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSBP53539 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms