Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFNA3P52797 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms