Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC3P51654 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC3P51654 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC3P51654 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC3P51654 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC3P51654 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC3P51654 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC3P51654 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms