Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms