Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT6CP48668 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms