Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSG1P42857 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSG1P42857 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSG1P42857 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSG1P42857 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSG1P42857 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSG1P42857 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSG1P42857 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSG1P42857 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSG1P42857 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSG1P42857 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NSG1P42857 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NSG1P42857 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms