Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA2P42262 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms