Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MLH1P40692 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MLH1P40692 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MLH1P40692 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MLH1P40692 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MLH1P40692 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLH1P40692 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MLH1P40692 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLH1P40692 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms