Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms