Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGAEP38570 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
ITGAEP38570 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms