Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGCXP38435 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GGCXP38435 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GGCXP38435 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GGCXP38435 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GGCXP38435 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GGCXP38435 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms