Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms