Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms