Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2H1P32780 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H1P32780 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms