Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP2P32456 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP2P32456 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP2P32456 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP2P32456 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP2P32456 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP2P32456 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms