Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND3P30281 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND3P30281 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND3P30281 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND3P30281 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND3P30281 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms