Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD1P29536 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD1P29536 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms