Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCAP28676 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCAP28676 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GCAP28676 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GCAP28676 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GCAP28676 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCAP28676 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCAP28676 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GCAP28676 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GCAP28676 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms