Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms