Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNE1P24864 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms