Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRDP23468 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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