Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACO1P21399 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACO1P21399 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACO1P21399 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACO1P21399 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms