Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNB1P20700 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms