Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM21P19474 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms