Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC3P19447 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms