Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DESP17661 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DESP17661 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DESP17661 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DESP17661 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DESP17661 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DESP17661 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DESP17661 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms