Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2A2P16615 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms