Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPCAMP16422 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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