Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTLA4P16410 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTLA4P16410 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms