Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VEGFAP15692 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFAP15692 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms