Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC130P13994 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC130P13994 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms