Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2F2P13984 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2F2P13984 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms