Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA4P13612 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms