Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP3P12645 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BMP3P12645 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BMP3P12645 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BMP3P12645 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BMP3P12645 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP3P12645 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP3P12645 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP3P12645 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP3P12645 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP3P12645 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP3P12645 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms