Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMC1P11047 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms