Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2P10911 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2P10911 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2P10911 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2P10911 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2P10911 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2P10911 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2P10911 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2P10911 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2P10911 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2P10911 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2P10911 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2P10911 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2P10911 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms